Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pramef12Q9D2F1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms