Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms