Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc6bQ9D289 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc6bQ9D289 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc6bQ9D289 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc6bQ9D289 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc6bQ9D289 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc6bQ9D289 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc6bQ9D289 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc6bQ9D289 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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