Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl53Q9D1H8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms