Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbcbQ9D1E6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbcbQ9D1E6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms