Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Hddc3Q9D114 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hddc3Q9D114 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Hddc3Q9D114 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Hddc3Q9D114 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hddc3Q9D114 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Hddc3Q9D114 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hddc3Q9D114 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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