Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc7Q9D0M0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Exosc7Q9D0M0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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