Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zbed3Q9D0L1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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