Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf146Q9CZW6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf146Q9CZW6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf146Q9CZW6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf146Q9CZW6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf146Q9CZW6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf146Q9CZW6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf146Q9CZW6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf146Q9CZW6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms