Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nde1Q9CZA6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms