Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Mrpl55Q9CZ83 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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