Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snf8Q9CZ28 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snf8Q9CZ28 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms