Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PmpcbQ9CXT8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PmpcbQ9CXT8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms