Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9CWU4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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