Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx2Q9CWK8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms