Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NubplQ9CWD8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms