Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Sycp2Q9CUU3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Sycp2Q9CUU3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sycp2Q9CUU3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms