Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fcf1Q9CTH6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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