Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms