Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PclafQ9CQX4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PclafQ9CQX4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms