Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms