Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nicn1Q9CQM0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nicn1Q9CQM0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms