Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rdm1Q9CQK3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rdm1Q9CQK3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms