Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700129C05RikQ9CQ77 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms