Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Use1Q9CQ56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Use1Q9CQ56 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Use1Q9CQ56 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Use1Q9CQ56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Use1Q9CQ56 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Use1Q9CQ56 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Use1Q9CQ56 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms