Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpd52l3Q9CQ14 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpd52l3Q9CQ14 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpd52l3Q9CQ14 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpd52l3Q9CQ14 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpd52l3Q9CQ14 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpd52l3Q9CQ14 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms