Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rnf17Q99MV7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf17Q99MV7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms