Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slc12a9Q99MR3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slc12a9Q99MR3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms