Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Gdpd3Q99LY2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms