Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cstf3Q99LI7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cstf3Q99LI7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms