Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp16Q99LG0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms