Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Abcf2Q99LE6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcf2Q99LE6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms