Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gps1Q99LD4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gps1Q99LD4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms