Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmp1Q99KU0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmp1Q99KU0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms