Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnf34Q99KR6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnf34Q99KR6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms