Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prpf19Q99KP6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms