Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ubxn2aQ99KJ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubxn2aQ99KJ0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 689.3 ms