Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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TrabdQ99JY4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrabdQ99JY4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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TrabdQ99JY4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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TrabdQ99JY4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms