Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lims1Q99JW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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