Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krcc1Q99JT5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms