Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Ddb2Q99J79 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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