Protein–RNA interactions for Protein: Q921K8

Tcaf2, TRPM8 channel-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf2Q921K8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tcaf2Q921K8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcaf2Q921K8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms