Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn8Q91VA3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms