Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Slc6a20aQ8VDB9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Slc6a20aQ8VDB9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Slc6a20aQ8VDB9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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