Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcoln3Q8R4F0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcoln3Q8R4F0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms