Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpm8Q8R4D5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms