Protein–RNA interactions for Protein: Q8R422

Cd109, CD109 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd109Q8R422 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd109Q8R422 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms