Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dnaaf4Q8R368 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dnaaf4Q8R368 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf4Q8R368 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf4Q8R368 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf4Q8R368 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dnaaf4Q8R368 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms