Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg10Q8R1P4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg10Q8R1P4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms