Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fndc5Q8K4Z2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms